Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS23P62266 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS23P62266 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms