Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms