Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms