Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms