Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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