Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BACE1P56817 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BACE1P56817 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BACE1P56817 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BACE1P56817 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms