Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPAP53621 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPAP53621 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms