Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms