Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV1P50549 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms