Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC1P48995 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms