Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms