Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPOP42166 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms