Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZEB1P37275 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZEB1P37275 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms