Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN2P35609 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms