Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP6P35125 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP6P35125 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP6P35125 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP6P35125 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP6P35125 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP6P35125 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP6P35125 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms