Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms