Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCAP28676 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCAP28676 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCAP28676 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms