Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms