Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMLP26374 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMLP26374 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMLP26374 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMLP26374 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms