Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO2P25791 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO2P25791 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO2P25791 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LMO2P25791 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LMO2P25791 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO2P25791 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms