Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA4P25789 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms