Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HRCP23327 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HRCP23327 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HRCP23327 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HRCP23327 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HRCP23327 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
HRCP23327 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HRCP23327 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HRCP23327 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms