Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI3P19429 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms