Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms