Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms