Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODC1P11926 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODC1P11926 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms