Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VSIG8P0DPA2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms