Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms