Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBP07199 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms