Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAP4K4O95819 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms