Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPO95166 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms