Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL18O94889 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms