Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms