Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms