Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP9BO43861 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms