Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms