Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms