Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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