Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms