Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms