Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms