Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL1BA8MQ27 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms