Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms