Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms