Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms