Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms