Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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