Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC9Q9Y3B6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC9Q9Y3B6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms