Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK1Q9UPV9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms