Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLEC4AQ9UMR7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms